全美中医药学会以九人组成理事会，其下分为两大功能机构：行政执行 部门与学术委员会。
行政执行部门分为：学术会务部、广告开发部、产业 发展部、继续教育部、财务审计部、募捐赞助部、国际语言部、国际会员 部、法律规划部、会员发展部、名师传承部、网络信息部、外联协调部、 宣传策划部、期刊图书部、专科培训部等十六个职能部门。
学术委员会包括：中医针灸、中药方剂、中医内科、骨伤康复、气功、中医皮肤、 中医妇科、中医肿瘤、中医神志病专业委员会、中医美容专业委员会、中医儿科专业委员会、中医药膳食疗养生专业委员会等十四个专业委员会。
全美中医药学会的宗旨乃团结以美国地区为主的中医药针灸专业人士 ，凝聚各种有利于中医药事业发展的力量，弘扬中医药针灸，提高行业水 准，致力参与维护公共健康，服务美国公众、中医药针灸业界及本会会员 。
我们将对外界大力宣传中医药、针灸，让民众对我们业界有足够的了解 与信任；以使有更多的美国民众接受中医药、针灸等疗法防治疾病。对于 业界，我们将定期举办各类型的网络与实地学术研讨会与培训班，不但提 高从业人员的专业水平与服务质量，更为广大中医针灸师、学生提供一个 增进相互联络、合作、开拓及贡献力量的平台。
此外我们也将参与立法， 提高中国医药针灸的合法地位及其权益；最终，使全美中医药学会成为美 国顶尖的行业协会。
1. 建立各专业学术委员会，以钻研学术为主，提升美国中医药针灸的整体学术水平 ；
2. 制定并执行美国中医药、针灸、气功、推拿等行业规范标准；
3. 举办学术会议、讲座、编写书籍，出版杂志等；
4. 举办名医传承授徒及专科培训班和专科认证；
5. 保护行业和会员利益 、提供法律咨询和帮助；
6. 参政议政、促进美国中医药、针灸的全面立法；
7. 开展中医药、针灸临床科研工作；
8. 寻找国内外合作伙伴，建起中美和世界的交流的桥梁；
9. 表彰杰出中医药针灸人物，评定授予职称；
10. 认证中药企业、中医针灸诊所；
11. 推广高品质的中药店、针灸诊所及供应商，鼓励政府监管部门采用“最佳实践”标准。